La Biósfera de Reserva del Manu es uno de los pocos espacios territoriales que encierran en su ámbito diversos ecosistemas que comprenden frígidas punas, que sobrepasan  los 4 000 metros sobre el nivel del mar, bosques sobre agrestes montañas que dan a una multitud de pequeñas quebradas, valles, bosques nublados de selva alta y llano amazónico, influidos por climas y altitudes diferentes, todo ello enmarcado en un amplio y complejo sistema hidrográfico.